Система менеджмента качества университета прошла оценку и регистрацию уполномоченной организацией NQA (г. Томск) на соответствие требованиям международного стандарта ISO 9001:2015 в следующих областях: проектирование, разработка и предоставление образовательных услуг в области основных образовательных программ высшего образования, дополнительного образования; научно-исследовательская и инновационная деятельность.
В ходе ресертификационного аудита СМК, проходившего в марте 2018 года, была реализована программа обучения работников университета по программе «Теория и практика СМК на основе международного стандарта ИСО 9001-2015. Внутренний аудит СМК».
Обучение проводил ведущий аудитор NQA, профессор Томского государственного университета Андрей Бабенко.